粗山羊草Dof转录因子家族基因的鉴定与分析

编号 zgly0001566403

文献类型 期刊论文

文献题名 粗山羊草Dof转录因子家族基因的鉴定与分析

作者 赵梦琪  周正富  齐豫川  晁岳恩  王美芳  何盛莲  李文旭  秦毛毛  吴政卿  雷振生 

作者单位 河南农业大学农学院河南省粮食作物协同创新中心  河南省农业科学院小麦研究所小麦国家工程实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年07期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S512.1 

关键词 粗山羊草  Dof转录因子  基因家族  表达谱 

文摘内容 Dof（DNA-binding one zinc finger）基因家族是植物特有的一类包含高度保守的C2-C2锌指结构域的转录因子,其在植物种子发育与萌发、光、激素以及逆境响应中起到重要调控作用。本研究基于已公布的粗山羊草基因组数据,采用生物信息学方法鉴定了粗山羊草Dof基因,并对其结构、保守结构域、染色体定位、系统进化树和表达谱进行了详细的分析。结果表明:粗山羊草Dof转录因子家族包含10个基因,它们均含有完整的C2-C2锌指保守结构域;每个基因含有13个内含子,AetDof家族蛋白共包含11个保守的模体;该家族基因除7号染色体外,在其余染色体上均有分布;与拟南芥Dof蛋白构建系统发育树发现,该家族基因可被分为3个亚族;转录组数据分析显示,粗山羊草Dof基因的表达具有组织特异性,其中3个转录因子（AetDof1,AetDof7,AetDof10）在种子中特异性强表达。本研究结果为深入解析粗山羊草Dof基因的功能提供了参考依据。