药用野生稻叶中花色苷合成基因的序列特点与表达差异

编号 zgly0001530996

文献类型 期刊论文

文献题名 药用野生稻叶中花色苷合成基因的序列特点与表达差异

作者 秦宗燕  刘石娟  包颖 

作者单位 曲阜师范大学生命科学学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 S511.9 

关键词 药用野生稻  叶转录组  花色苷合成途径  基因表达 

文摘内容 为全面把握花色苷合成基因在非模式植物绿色组织中的构成和表达,本研究利用转录组重测序方法,对药用野生稻(Oryza officinalis)绿叶中出现的花色苷合成基因进行了分析,结果共鉴定出8个相关基因(CHS、CHI、F3H、F3′H、F3′5′H、DFR、ANS和UFGT),这些基因与栽培稻同源基因对之间在mRNA水平上的序列相似度达到了94%~96%。相对外类群的K_a/K_s(非同义替换率与同义替换率的比值)统计检验进一步表明这8个基因均处于严格的纯化选择之下。RPKM(每百万读段中每千个碱基长度的读段数)值分析表明,8个基因的表达水平不同,其中F3′5′H的相对表达量最高,CHI和CHS次之,F3′H最低。