猪圆环病毒2型青海分离株的分子鉴定及进化分析

编号 zgly0001644779

文献类型 期刊论文

文献题名 猪圆环病毒2型青海分离株的分子鉴定及进化分析

作者 赵玉清 

作者单位 青海省海北藏族自治州畜牧兽医科学研究所 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2018年09期

年份 2018 

分类号 S852.651 

关键词 猪圆环病毒  青海分离株  分子鉴定  Cap基因  序列比对  进化分析 

文摘内容 本研究对青藏高原地区猪圆环病毒青海分离株(PCV2-QH1)进行了Cap基因的克隆鉴定及测序分析,并与我国及其他国家或地区的毒株进行了同源性比较和遗传进化分析。结果显示:PCV2-Cap基因核苷酸序列全长705 bp,编码蛋白为234个氨基酸,分子量大小约28.06 k Da,为不稳定蛋白,总体亲水性非常高,可溶于水;PCV2-Cap蛋白二级结构以无规则卷曲为主,有多个有效的抗原表位;PCV2-QH1分离株与其他参考序列的核苷酸和氨基酸序列同源性均在99%以上;PCV2-QH1分离株与PCV2美国分离株(KU697156)组成一个微小分支,并与美国毒株、韩国毒株聚在一支,表明它们之间的亲缘关系最近。本次对青海分离株PCV2-QH1的鉴定,可为我国猪圆环病毒分子流行病学调查提供数据参考。