莲瓣兰花朵转录组及MADS基因家族挖掘

编号 zgly0001529041

文献类型 期刊论文

文献题名 莲瓣兰花朵转录组及MADS基因家族挖掘

作者 肖靖译  朱永平  江周  贾茸  吴林鲜  余琨  徐玉峰  张应华  和凤美 

作者单位 云南农业大学  云南省建水县农业技术推广所  云南省会泽县种子管理站 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年10期

年份 2016 

分类号 S682.31 

关键词 莲瓣兰  花朵  转录组  生物信息 

文摘内容 莲瓣兰是我国珍贵的兰花野生资源,具有很高的观赏价值,然而其相关的分子生物学研究尚属空白。为揭示莲瓣兰花朵形成的分子机制,应用高通量测序技术对莲瓣兰花朵进行转录组分析。原始数据经过生物信息学分析后,共获得57 011条Unigene;所获得的Unigene与Nr,Swiss-prot,COG和KEGG等数据库进行搜索比对后,发现Unigene的注释总量为24 049条,约32 962条Unigene没获得注释,这些没获得注释Unigene基因可被认为是莲瓣兰新的转录本和特异基因。36条CDS基因被注释为MADS-box基因,构建系统进化树后并对31条MADS-box基因进行了聚类,其中23条为与花型发育相关的ABCDE类基因,8条为与开花时间相关的MADS基因,同时发现PI、AP3和AGL6基因表达量较高,该试验为研究兰属的花发育以及开花机理的研究提供一定的理论依据。