基于PCR技术的人脑基因可变剪接差异性研究

编号 zgly0000793467

文献类型 期刊论文

文献题名 基于PCR技术的人脑基因可变剪接差异性研究

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张晓宇  熊洁仪  梁洪雨  邵宁一  Philipp  Khaitovich  杨洪一 

作者单位 东北林业大学生命科学学院  中国科学院一马普学会计算生物学伙伴研究所 

母体文献 现代生物医学进展 

年卷期 2012,12(6)

页码 1013-1016

年份 2012 

分类号 Q75 Q78 

关键词 可变剪接  聚合酶链式反应  mRNA前体  RNA-seq  大脑前额叶皮层 

文摘内容 目的: 对人脑的基因可变剪接位点差异性进行分析。方法: 通过RNA-Seq得到的转录组数据,分析推测出在不同年龄的7对样本的大脑前额叶皮层(prefrontal cortex,PFC)表达的某些基因具有可变剪接位点的差异性;为验证此推测,设计7对引物,提取不同年龄样本的RNA,通过反转录合成cDNA,采用PCR技术扩增目的序列。结果: 在已剪接和(或)未剪接产物预期片段处有明显的条带。结论: 通过Quantity One软件分析后,确定在不同年龄间存在可变剪接差异。基于PCR技术的基因可变剪接分析对RNA-seq数据集的预测结果进行验证是一种有效新颖的PCR新应用。