基于RNA-seq的水稻根尖和侧根区愈伤组织诱导中生长素相关基因差异表达分析

编号 zgly0001715735

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-seq的水稻根尖和侧根区愈伤组织诱导中生长素相关基因差异表达分析

作者 黄伊子  郭芾  韩凝  边红武 

作者单位 浙江大学生命科学学院遗传与再生生物学研究所 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年08期

年份 2020 

分类号 S511 

关键词 愈伤组织  RNA-seq  生长素  根  水稻 

文摘内容 本研究以愈伤诱导培养基(CIM)诱导24 h的水稻(Oryza sativa)主根为材料,利用高通量转录组测序(RNAseq)技术进行主根根尖和侧根区的基因差异表达分析。通过对生长素信号相关基因家族进行聚类和差异表达分析后发现:生长素受体基因OsTIR/AFBs及其同源基因在根尖和侧根区组织的愈伤诱导过程中均无明显的差异表达;系统进化关系接近的OsIAA20、OsIAA9等10个OsIAA基因在根尖和侧根区均增强表达;而另一组进化关系相邻的Os IAA11和Os IAA13基因在根尖和侧根区表现出相反的差异表达模式。相比而言, Os ARFs家族基因在根尖和侧根区中对生长素诱导的表达变化具有明显的差异性。本研究分析了在根尖和侧根区组织生长素信号相关家族基因差异表达的异同,拟为根愈伤组织诱导中生长素响应的组织特异性研究提供新参考。