比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用

编号 zgly0001645294

文献类型 期刊论文

文献题名 比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用

作者 成斌  许伟  胡从从  贺学礼  赵丽莉 

作者单位 河北大学生命科学学院  兰州大学生命科学学院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2018年09期

年份 2018 

分类号 Q948.1 

关键词 AM真菌  形态学方法  二代测序  群落结构和多样性  荒漠生境 

文摘内容 采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性。结果表明,应用NGS共鉴定AM真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定2纲2目2科5属,形态学鉴定1纲2目2科3属。AM真菌分类等级越低,NGS、DGGE和形态学鉴定结果差异越大,尤其在属水平上差异显著。与NGS技术相比,形态学和DGGE方法所反映AM真菌种类主要为优势菌种,显著低估了AM真菌物种组成并高估其丰度,分子测序是对形态学分类的补充和完善。