山核桃SSR标记的初步开发

编号 zgly0001414373

文献类型 期刊论文

文献题名 山核桃SSR标记的初步开发

作者 宋双  黄银芝  董雷鸣  黄有军  曾燕如  吴智敏 

作者单位 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地  浙江省龙泉市林业局 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2012年04期

年份 2012 

分类号 S664.1 

关键词 经济林学  EST-SSR  山核桃  cDNA文库 

文摘内容 基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物;建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验。结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8%。将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点。结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的。