辣椒属种资资源ITS序列与系统进化分析

编号 zgly0001460037

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒属种资资源ITS序列与系统进化分析

作者 刁卫平  王述彬  刘金兵  潘宝贵  戈伟 

作者单位 江苏省农业科学院蔬菜研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2013年06期

年份 2013 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒属  ITS  系统发育  亲缘关系 

文摘内容 分析辣椒属ITS序列,为辣椒属系统位置、进化关系提供分子生物学依据。以辣椒属(Capsicum)4个栽培种36份不同基因型辣椒种质资源为试材,对其rDNA转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)进行PCR扩增。扩增产物经纯化、克隆和测序后,获得ITS序列信息,随后利用MEGA 5.05软件分析其序列特征,并探讨了辣椒属种质资源的系统进化关系。结果表明,辣椒属ITS基本序列全长656 bp,G+C含量57.47%。供试材料的ITS序列长度变异较大,ITS1、5.8S和ITS2区长度变异都有发生。序列比对表明,供试辣椒材料ITS区共有387个变异位点(ITS1:153;5.8S:82;ITS2:152),信息位点322个,同源性为71.0%~100%,遗传分歧为0~0.3604。以烟草为外类群,将ITS1、5.8S和ITS2序列作为一个共同的数据矩阵进行系统发育树构建,辣椒属C.frutescens和C.baccatum种被单独分出,C.chinense和C.annuum种聚在一起,C.annuum与其他3个栽培种的亲缘关系由近至远分别是C.chinense、C.frutescens和C.baccatum,C.annuum种的32份供试材料主要分为3个分支6个亚分支,聚类分析结果与形态分类不能完全对应。