拟南芥次生生长相关NAC转录因子保守结构域分析

编号 zgly0001354194

文献类型 期刊论文

文献题名 拟南芥次生生长相关NAC转录因子保守结构域分析

作者 陈莹  孙霞  胡尚连  曹颖  卢学琴 

作者单位 西南科技大学生命科学与工程学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2009年05期

年份 2009 

分类号 Q943 

关键词 拟南芥  次生生长  NAC转录因子  生物信息 

文摘内容 【目的】了解植物次生生长调控网络以及挖掘新型次生生长相关NAC转录因子。【方法】通过生物信息学手段对19个拟南芥次生生长相关NAC转录因子进行氨基酸序列比对及系统发生树的构建,寻找保守结构域,并对其保守结构域及蛋白质的二级结构、亚细胞定位等进行分析、预测。【结果】通过对19个拟南芥NAC转录因子的N端保守域进行划分,共发现A、B、C、D、E5个保守性不同、同时含有多个化学修饰位点以及疏水性区域的亚结构域,其中亚域D可能涉及DNA绑定及核定位信号功能,而位于多变氨基酸序列C端的F区与G区,可能涉及转录激活功能,而该区域也是划分次生生长相关NAC转录因子亚家族的重要区域。【结论】拟南芥NAC类转录因子的保守结构域,对于次生生长NAC转录因子家族功能的发挥具有重要作用。