新疆野苹果NAC基因分析及抗腐烂病基因筛选

编号 zgly0001713942

文献类型 期刊论文

文献题名 新疆野苹果NAC基因分析及抗腐烂病基因筛选

作者 周童  李小双  刘晓洁  丁雨  文雪静  张道远 

作者单位 中国科学院新疆生态与地理研究所·荒漠与绿洲生态国家重点实验室  石河子大学生命科学学院  中国科学院吐鲁番沙漠植物园  中国科学院大学 

母体文献 果树学报 

年卷期 2020年08期

年份 2020 

分类号 S436.611.11 

关键词 新疆野苹果  NAC转录因子  苹果腐烂病  抗病基因 

文摘内容 【目的】探明新疆野苹果(Malus sieversii)中NAC基因资源,筛选潜在的抗腐烂病NAC基因。【方法】以模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)的NAC蛋白为种子构建隐马可夫模型,从新疆野苹果转录组数据库中鉴定NAC转录因子,利用Protparam及qRT-PCR等手段对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、系统进化及腐烂病菌侵染后的表达谱进行分析。【结果】从新疆野苹果中鉴定到165个NAC基因,根据蛋白系统进化关系分为12个亚组,且MsNACs在各亚组间分布不均。蛋白理化性质分析结果表明,MsNACs大多属酸性,且多为亲水性蛋白。保守基序分析结果表明,大多数MsNAC转录因子拥有由7个保守基序组成的完整NAC结构域,少数存在亚结构域的缺失。膜结合域分析结果表明,有18个MsNACs蛋白具有膜结合域,且大多定位于细胞核,少数定位于内质网、线粒体等其他细胞器。表达分析结果表明,34个MsNACs在腐烂病菌侵染后差异表达,可根据表达模式分为A、B、C三个亚簇,其中MsNAC073和MsNAC102表达变化剧烈,分别在5 dpi下调近6倍和上调近140倍。【结论】基于新疆野苹果转录组数据,首次对MsNAC家族基因进行鉴定、分类和表达量分析,为新疆野苹果抗病响应关键NAC基因的功能研究奠定了基础,也为其他物种中抗病基因的筛选提供了参考。