暗纹东方鲀线粒体DNA控制区结构和系统发育分析

编号 zgly0000504177

文献类型 期刊论文

文献题名 暗纹东方鲀线粒体DNA控制区结构和系统发育分析

作者 邵爱华  朱江  史全良  陈葵 

作者单位 苏州大学生命科学学院  苏州科技学院生物系 

母体文献 中国水产科学 

年卷期 2007,14(3)

页码 352-360

年份 2007 

分类号 Q959.468 

关键词 暗纹东方纯  mtDNA控制区  系统关系 

文摘内容 以暗纹东方纯(Takifugu fasciatus)肝脏线粒体DNA为模板, 参照GenBank中红鳍东方纯(Takifugu rubripes)线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增, 获得了暗纹东方纯线粒体DNA控制区基因(818bp)及5’端上游的tR-NA^Pro基因(71bp)的全序列。控制区碱基组成为T32.2%, C19.1%, A35.6%, G13.2%。对照其他已报道的鱼类控制区结构, 对暗纹东方纯控制区的结构进行了分析, 识别了其终止序列区、中央保守区和保守序列区, 找到了终止相关的序列TAS以及保守序列(CSB1, CSB2, CSB3)。CSB1、CSB2序列相对保守, TAS与其回文基序可形成稳定的茎环结构, 成为H-链复制延伸时的终止识别位点。同时运用DNA分析软件对暗纹东方纯与GenBank中其他10多种鱼类的mtDNA控制区序列进行比对, 并选取东方纯属的7种鱼类mtDNA控制区序列构建分子系统树。结果显示控制区基因较适于纯科鱼类中同属不同种的系统发育分析。