入侵害虫松树蜂气味结合蛋白与其相关信息化学物质的分子对接

编号 zgly0001690194

文献类型 期刊论文

文献题名 入侵害虫松树蜂气味结合蛋白与其相关信息化学物质的分子对接

作者 郭冰  郝恩华  王菁桢  陆鹏飞  乔海莉 

作者单位 北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室  中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S763.43 

关键词 松树蜂  气味结合蛋白  信息素  植物挥发物  同源模建  分子对接 

文摘内容 为探究入侵我国的重大林业检疫性害虫松树蜂Sirex noctilio的气味结合蛋白（odorant binding protein,OBP）与其相关信息化学物质的结合模式和结合能力,采用Swiss-model在线服务器对松树蜂触角中高表达的4种OBP序列进行同源模建,采用Procheck、Verify3D和ERRAT程序对模建质量进行评价;并应用Autodock软件对OBP模型和相关信息化学物质进行分子对接分析。结果显示,在松树蜂触角中高表达的4种蛋白为SnocOBP4、SnocOBP6、SnocOBP9和SnocOBP12,其同源模建所得模型质量较好:均满足拉氏构象图中氨基酸位于最佳合理区的数量大于90%的条件;三维结构与一级结构的兼容性评分大于0.2;所得ERRAT值分别为85.71%、95.10%、98.15%和91.82%。分子对接显示,与松树挥发物α-蒎烯和β-蒎烯结合最好的蛋白是SnocOBP12,结合能分别为-5.36 kJ/mol和-5.48 kJ/mol;与雌性信息素成分顺-9-二十九烯结合最好的蛋白是SnocOBP4,结合能为-5.42 kJ/mol;与雄性信息素成分顺-3-癸烯醇和顺-4-癸烯醇结合最好的蛋白是SnocOBP9,结合能分别为-4.37 kJ/mol和-4.45 k J/mol;而3-蒈烯、顺-7-二十七烯和反-2,4-癸二烯醛等气味分子与SnocOBP6的结合能较低,结合能最低的是顺-7-二十七烯,为-6.08 k J/mol。雄蜂主要信息素成分顺-3-癸烯醇与其同分异构体反-3-癸烯醇相比,与SnocOBP9的结合能较低;但是反-3-癸烯醇能以较强的氢键竞争SnocOBP9结合位点。研究表明这4种松树蜂OBP与相应植物挥发物或雌雄信息素具有较好的亲和力,参与了松树蜂对不同信息化学物质的识别过程。