葡萄WRKY转录因子家族全基因组分析

编号 zgly0000815633

文献类型 期刊论文

文献题名 葡萄WRKY转录因子家族全基因组分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李成慧  蔡斌 

作者单位 苏州农业职业技术学院  南京农业大学园艺学院 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2013(4)

页码 127-131

年份 2013 

分类号 S663.1 

关键词 葡萄  WRKY基因  生物信息学  进化  全基因组分析 

文摘内容 为了给进一步开展葡萄WRKY基因家族的功能和分子进化机制的研究提供理论依据, 利用葡萄全基因组数据, 采用生物信息学的方法, 在葡萄全基因组水平上对葡萄WRKY基因家族进行了系谱进化关系、保守模体、共线性关系及表达情况等方面的分析。结果表明, 葡萄基因组中共存在55个WRKY基因, 命名为VvWRKY1～VvWRKY55, 这些WRKY基因归属于7个亚家族。共线性分析结果表明, 亚家族IIb的6个成员可能起源于形成葡萄物种的“古代六倍体化”事件。对公共数据库中葡萄RNA—Seq数据的分析结果表明, 有9个WRKY甚i天f对毕物和韭毕物腓泊有晌商.