油菜超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析

编号 zgly0001693879

文献类型 期刊论文

文献题名 油菜超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析

作者 郭栋  张艳阳  杜媚  周宝元  高卓晗  赵明  袁卉馥 

作者单位 中国农业科学院作物科学研究院  东北农业大学农学院  河北北方学院农林科技学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 S565.4 

关键词 油菜(Brassicanapus)  超氧化物歧化酶  基因家族 

文摘内容 超氧化物歧化酶(SOD)是重要的抗氧酶,在生物体内广泛存在。以油菜基因数据库为搜索平台,通过对油菜超氧化物歧化酶基因家族进行生物信息学分析。结果表明:油菜SOD基因家族主要含有32个基因,蛋白质的氨基酸序列长度86 aa～386 aa之间。BanSODs基因具有相对保守的结构,即包含SOD DNA结构域;HMA DNA结构域;Mn/N DNA结构域;Mn/C DNA结构域,SOD蛋白结构中含有7个α螺旋和4个β折叠结构域。进化树分析表明油菜SOD蛋白序列与谷子、小立碗藓蛋白序列具有相对较高的同源性。该研究结果可以为进一步了解油菜SOD基因家族和玉米抗氧化机制提供一定参考。