基于微卫星技术的赣南脐橙溃疡病菌遗传多样性分析

编号 zgly0001514463

文献类型 期刊论文

文献题名 基于微卫星技术的赣南脐橙溃疡病菌遗传多样性分析

作者 赖爱萍  易龙  黄爱军  苏华楠  赵培娅 

作者单位 赣南师范大学生命与环境科学学院  国家脐橙工程技术研究中心 

母体文献 中国南方果树 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S436.66 

关键词 赣南  柑桔黄单胞菌柑桔亚种  遗传多样性  微卫星技术 

文摘内容 在赣南18个县(市、区)收集到508份柑桔溃疡病菌样品,采用已报道的柑桔溃疡病菌A菌系306菌株(GenBank Accession no.AE008923)基因组上的14个SSR位点分析遗传多样性。从14个SSR位点中,筛选出用于赣南地区溃疡病菌种群多样性研究的SSR位点7个(XL1、XL2、XL3、XL4、XL5、XL6和XL7),测试得到的Nei’s基因多样性指数在0.66~0.83之间。通过这7个位点分析赣南不同地域的样品发现,大余县样品的遗传多态性最高,定南县样品的遗传多态性最低。采用Structure 3.25和PowerMarker 2.3.4软件聚类分析发现,赣南18县(市、区)的柑桔溃疡病菌样品分成两个组群,且某些县(区)群体结构构成单一。其中,信丰、定南和章贡区样品群体属于同一组群,兴国和会昌样品群体属于另一组群,其他县(区)样品群体则是由两个组群菌株按不同比例混合构成。