油茶乙酰CoA酰基转移酶基因cDNA克隆及序列特征分析

编号 zgly0000776569

文献类型 期刊论文

文献题名 油茶乙酰CoA酰基转移酶基因cDNA克隆及序列特征分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 张琳  谭晓风  胡姣  姚小华  林萍 

作者单位 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家重点实验室  中国林业科学研究院亚热带林业研究所 

母体文献 中南林业科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2011,31(8)

页码 108-112

年份 2011 

分类号 S794.4 

关键词 油茶  乙酰CoA酰基转移酶  快速扩增cDNA末端  生物信息学分析 

文摘内容 在已知油茶乙酰COA酰基转移酶基因EST序列基础上, 设计6条特异引物, 以油茶优良无性系‘湘林1号’种仁总RNA为模板, 通过反应体系和反应条件优化, 最终扩增出一条700bp左右的目的片段, 将该片段回收、克隆、测序, 获得718bp的cDNA序列, 将该序列与油茶乙酰COA酰基转移酶基因进行序列拼接, 确定了油茶乙酰COA酰基转移酶基因的全长cDNA序列, 将该序列提交至GeneBank, 登录号为GU594059。油茶乙酰COA酰基转移酶基因全长cDNA序列为1495bp, 含有一个1227bp的ORF, 编码408个氨基酸残基。在氨基酸序列水平上, 该基因与胡黄连(P.kurrooa)的乙酰COA酰基转移酶基因的相似性最高, 为86%, 与稻瘟病菌(Mgrisea)的最低, 为65%。通过在线预测, 油茶乙酰COA酰基转移酶基因编码蛋白的等电点pI为6.19, 分子量Mw为41628.6Da。本研究为揭示油茶油脂合成规律和油茶的分子育种提供了理论依据和科学基础。