西瓜枯萎病菌遗传多样性的相关序列扩增多态性分析

编号 zgly0001643866

文献类型 期刊论文

文献题名 西瓜枯萎病菌遗传多样性的相关序列扩增多态性分析

作者 刘丽芳  肖姬玲  张屹  朱菲莹  魏林  梁志怀 

作者单位 湖南大学研究生院隆平分院  湖南省农业生物技术研究所  湖南省植物保护研究所 

母体文献 植物保护 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 S436.5 

关键词 西瓜枯萎病菌  SRAP分析  遗传多样性 

文摘内容 对30个西瓜枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp.niveum菌株基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析,以探究其遗传多样性与地理来源的关系。采用尖孢镰刀菌西瓜专化型Fusarium oxysporumf.sp.niveum0、1、2号生理小种的基因组DNA为模板,对225对SRAP引物进行筛选,筛选出20对多态性、重复性较好且条带清晰的引物,对30个菌株进行PCR扩增,共扩增出386条带,其中多态性条带有371条,多态性比率为96.11%,平均每对引物扩增出19.3个位点和18.55个多态性位点。UPGMA法聚类分析结果显示,供试菌株两两之间的遗传相似系数范围为0.69~0.90,平均为0.79,说明尖孢镰刀菌西瓜专化型的遗传多样性较为丰富。基于SRAP标记聚类分析表明,30个菌株在遗传相似系数为0.70处被划分为3个类群,I类群包含24个菌株,其中18个来自湖南省,Ⅱ类群只包含1个来自黑龙江省哈尔滨市的菌株,它和另一个来自黑龙江地区的菌株被划分到不同的类群,且遗传距离相对较远;Ⅲ类群包含了5个菌株,其中3个来自海南三亚,其余两个来自湖南省。根据菌株的分布情况来看,菌株的聚集与地理来源没有明显的相关性。