山核桃(Carya cathayensis)种子生长发育过程转录组的初步分析

编号 zgly0001639780

文献类型 期刊论文

文献题名 山核桃(Carya cathayensis)种子生长发育过程转录组的初步分析

作者 董昂  赵国淼  胡欢欢  陈文充  叶生月  曾燕如 

作者单位 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室  桐庐县农业产业化办公室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 S664.1 

关键词 山核桃  种子  转录组  RNA-seq  基因注释 

文摘内容 山核桃(Carya cathayensis)是浙江省重要的经济树种,其种子脂类含量极高,达69.80%~74.01%。本研究采用Illumina Hi Seq TM 2000高通量测序技术对高油种子生长发育过程(6个时间点)采集的种胚及胚乳进行转录组分析,经组装拼接共获得Unigene 110 959条,占总转录本数的53.93%,并有39 560个Unigene至少在7个数据库中的一个数据库中获得注释。这些注释的基因GO分类共涉及47个生物学功能,KOG分类成26组,KEGG代谢通路分成5个分支。基因差异表达分析表明,胚乳在种子生长发育被吸收的过程中基因表达量不低,上下调基因数均是先增加后减少,而同一时间点上下调胚与胚乳差异表达基因(DEG)数均逐渐增加。DEG聚类分界点在7~8月之间。初步发现山核桃种子生长发育过程涉及脂类合成的途径21个,相关基因571个。这些结果为山核桃日后成油机理的研究打下了基础。