山茶属CHS基因家族的组成和分子进化初探(英文)

编号 zgly0001273358

文献类型 期刊论文

文献题名 山茶属CHS基因家族的组成和分子进化初探(英文)

作者 杨俊波  田欣  李德铢  郭振华 

作者单位 中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学开放实验室  中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学开放实验室 昆明650204  昆明650204  昆明650204 

母体文献 Acta Botanica Sinica 

年卷期 2003年06期

年份 2003 

分类号 Q943 

关键词 山茶属  查尔酮合酶(CHS)  基因家族  分子进化 

文摘内容 用PCR方法从 4种山茶属 (Camellia) (山茶科 ) (Theaceae)植物的总DNA中分别扩增到CHS基因外显子 2的部分序列 ,经克隆、测序得到 16个该基因的序列 ,这些序列与来自GenBank的该属另一种植物的 3个序列及作为外类群的大豆 (Glycinemax (L .)Merr.)的 2个序列一起进行分析。研究表明 ,山茶属CHS基因家族在进化过程中已分化为A、B、C三个亚家族 ,包括A1、A2、A3、B1、B2、C等 6类不同的基因成员 ;其中只有A2类成员为全部被研究的5种植物所共有 ,而其他 5类成员只在部分被研究的植物中发现 ;所有这些CHS成员具有很高的同源性 :在核苷酸水平上同一亚家族内基本上高于 90 % ,不同亚家族间也在 78%以上。从推测的氨基酸组成看 ,山茶属内CHS基因的功能已发生了分化 ,各类成员的碱基替代率有较大差异 ;从分子系统发育树和可能的氨基酸组成分析 ,山茶属具有新功能的基因成员是在经过基因重复后 ,或是由少数几个位点的突变而成 ,或是由逐渐积累的突变而形成的。进一步分析认为 ,该属CHS基因的分化直到近期还在活跃地进行 ,并且不同种的进化式样有一定的差别 ,这种不同的进化式样可能是物种形成后受不同环境因素影响而形成的