柑橘Ptcor8基因相关功能的生物信息学分析

编号 zgly0000663945

文献类型 期刊论文

文献题名 柑橘Ptcor8基因相关功能的生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘湘志  龙桂友  邓子牛 

作者单位 湖南农业大学园艺园林学院  国家柑橘改良中心长沙分中心 

母体文献 湖南农业大学学报: 自然科学版 

年卷期 2011,37(2)

页码 161-165

年份 2011 

分类号 Q343.1 

关键词 柑橘  Ptcor8基因  生物信息学  功能分析  冷诱导 

文摘内容 应用生物信息方法,对柑橘Ptcor8基因的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析。结果表明: Ptcor8隶属于植物WCOR413冷诱导蛋白家族,具有1个621 bp的潜在编码区,编码206个氨基酸残基;功能预测结果显示,Ptcor8编码蛋白质的相对分子质量为2.28×106,等电点为9.4,具有5个疏水区,5个跨膜螺旋,6个丝氨酸磷酸化位点;亚细胞定位和分子系统发育分析结果均表明,Ptcor8为质膜型冷诱导蛋白,Ptcor8可能为冷诱导基因,在提高植物抗寒能力方面有重要的作用。