西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析

编号 zgly0000694188

文献类型 期刊论文

文献题名 西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析

学科分类 220.3010;森林病理学

作者 吴宽  颜永杰  王海妮  张珏 

作者单位 西北大学信息科学与技术学院  西北大学生命科学学院 

母体文献 干旱地区农业研究 

年卷期 2010(3)

页码 265-268

年份 2010 

分类号 S665.1 

关键词 枣疯病  植原体  核糖体蛋白基因  序列分析  生物信息学 

文摘内容 枣疯病是枣树上的一种具有毁灭性的植原体病害,几乎分布于国内所有的枣树栽培区,造成了巨大的经济损失。对我国陕西、宁夏、甘肃3省枣疯病样品植原体核糖体蛋白基因进行克隆和测序,获得枣疯病植原体的核糖体基因片段为1 196bp,包含部分rps19,rpl22和rps3三个基因,其中rpl22和rps3大小分别354bp和753bp,分别编码118和251个氨基酸,且这两个基因为非重叠基因。序列同源性比较结果表明: 我国陕西、宁夏、甘肃的枣疯病植原体的核糖体蛋白rp基因大小一致,归属于植原体16SrⅤ-B组;该植原体核糖体蛋白基因特性与樱桃致死黄化(CLY5)和桃树黄化印度分离株系(PY-In)植原体相似。首次报道了我国枣疯病核糖体蛋白基因rp基因的序列,把枣疯病植原体归到16SrⅤ-B组,为枣疯病植原体提供了新的分类依据。