辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析

编号 zgly0001514153

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析

作者 魏兵强  王兰兰  张茹  陈灵芝  张少丽  张建农 

作者单位 甘肃农业大学园艺学院  甘肃省农业科学院蔬菜研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  海藻糖–6–磷酸合成酶基因  全基因组鉴定  基因表达 

文摘内容 利用生物信息学方法,从辣椒全基因组数据库中共鉴定出11个辣椒TPS基因,除Ca TPS3含有1个TPS和2个TPP结构域外,其余分别含有1个TPS和1个TPP结构域。11个Ca TPS分为2类,ClassⅠ包含3个基因(Ca TPS1~Ca TPS3),分别含有16、16和13个内含子,Ca TPS1和Ca TPS2含Motif 1~Motif 5各1个,而Ca TPS3含有2个Motif 4和1个Motif 3。ClassⅡ包含8个基因(Ca TPS4~Ca TPS11),均含有2个内含子,且分别含Motif 1~Motif 6各1个。利用荧光定量PCR对Ca TPS1在辣椒组织表达的特异性和低温应答模式进行分析,结果表明:Ca TPS1在叶片中的表达量大约是根和茎中的5~6倍,说明Ca TPS1的表达具有明显的组织特异性;低温处理后Ca TPS1在根和茎中的表达高峰出现时间明显早于叶片,说明不同组织中Ca TPS1对低温胁迫的应答时间存在一定差异。