基于荧光标记的茶树花转录组序列SSR标记开发

编号 zgly0001648438

文献类型 期刊论文

文献题名 基于荧光标记的茶树花转录组序列SSR标记开发

作者 邓少春  陈林波  田易萍  陈春林  徐丕忠  李朝云  梁名志 

作者单位 云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心云南省茶学重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年18期

年份 2018 

分类号 S571.1 

关键词 茶树花  转录组  SSR  荧光标记 

文摘内容 本研究对204 199条茶树花转录组Unigenes进行SSR简单重复序列的查找,得到含有SSR的序列60 581个,出现频率为29.67%。EST-SSR重复类型以单核苷酸和二核苷酸为主,占总SSR比例的85.69%,其中主要重复基序类型为单核苷酸,占总SSR的47.97%,A/T重复类型出现最多。采用荧光标记PCR技术对设计合成的100对SSR引物进行引物筛选,其中有28对引物扩增条带清晰、多态性好,在4个品种的茶树花中得到有效性验证。结果表明,茶树花转录组的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发对茶树花遗传多样性分析、分子育种和开发茶树不育相关的SSR标记等具有重要意义。