大青叶蝉内共生菌的检测及其16S rRNA基因序列分析

编号 zgly0001544544

文献类型 期刊论文

文献题名 大青叶蝉内共生菌的检测及其16S rRNA基因序列分析

作者 练启仙  刘健锋  杨茂发  罗亭  吴广  周小芸 

作者单位 贵州大学昆虫研究所贵州省山地农业病虫害重点实验室  兴义民族师范学院 

母体文献 环境昆虫学报 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 Q963  S433.39 

关键词 大青叶蝉  内共生菌  16S rRNA基因  单倍型  系统发育 

文摘内容 用细菌通用引物27F-1513R对大青叶蝉内共生菌的16S r RNA基因进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳,克隆、测序、序列比对与分析,用贝叶斯法和极大似然法构建系统发育树。结果表明:从大青叶蝉体内鉴定出Sulcia muelleri和Sodalis sp.2种内共生菌,Sulcia muelleri隶属于拟杆菌门Bacteroidetes黄杆菌纲Flavobacteria黄杆菌目Flavobacteriales黄杆菌科Flavobacteriaceae,该内共生菌获得13个新单倍型,14个变异位点,其序列间的一致率为和遗传距离分别为99.40%-99.80%和0.001-0.004;系统发育树显示,Sulcia muelleri与大叶蝉亚科中检测到的Sulcia muelleri聚在一起,其变异程度低,所有单倍型为同一个种。Sodalis sp.属于变形杆菌门Proteobacteria伽马变形菌纲Gammaproteobacteria肠杆菌目Enterobacteriale肠杆菌科Enterobacteriaceae,本研究获得5个新单倍型,20个变异位点,其序列间的一致率为96.10%-99.70%,遗传距离范围为0.012-0.040;系统发育树显示,Sodalis sp.与采采蝇检测到的Sodalis glossinidius聚在一起,其变异程度相对较大,属于同一个属。