斑茅两个看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的应用

编号 zgly0000518979

文献类型 期刊论文

文献题名 斑茅两个看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的应用

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张积森  李伟  阙友雄  阮妙鸿  张木清  陈如凯 

作者单位 福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室  福建师范大学生命科学学院 

母体文献 热带亚热带植物学报 

年卷期 2007,15(4)

页码 277-283

年份 2007 

分类号 Q943.2 

关键词 斑茅  看家基因  基因芯片  PEG 

文摘内容 根据已发表的同源基因序列,利用RT-PCR技术分离了斑茅(Erianthus arundinaceus)的GAPDH和APRT两个看家基因片段,用它们作为cDNA芯片阳性参照,以未经聚乙二醇(PEG)胁迫处理的斑茅叶片为对照,和PEG胁迫的4组材料同cDNA芯片进行杂交分析.杂交结果显示,GAPDH杂交的Cy5与Cy3平均信噪比(Signal/Noise,S/N)分别为56.12和60.8,APRT杂交的Cy5与Cy3平均信噪比分别为51.06和47.25,信噪比均很高;同时两个看家基因的杂交都显示出极强的信号,其中GAPDH的杂交信号值大于10 000,APRT也在8 000以上,杂交结果可靠.分析了PEG胁迫4个时段BADH与两个看家基因的表达,BADH的表达有明显变化,而看家基因表达均较稳定.上述结果表明所克隆的两个看家基因在斑茅中表达量高,且PEG胁迫下表达较为稳定,是基因芯片理想的阳性参照。