梨S基因检测芯片的oligo探针设计

编号 zgly0000802300

文献类型 期刊论文

文献题名 梨S基因检测芯片的oligo探针设计

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 江南  谭晓风 

作者单位 湖南工业大学包装与材料工程学院绿色包装与生物纳米技术应用湖南省重点实验室  中南林业科技大学资源与环境学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2012(3)

页码 1-5

年份 2012 

分类号 S661.2 

关键词 梨  自交不亲和性  S-RNase  oligo探针 

文摘内容 为给梨品种S基因芯片的制备及梨品种自交不亲和性S-RNase基因和S基因型的检测奠定基础, 结合已有的对梨自交不亲和S-RNase基因的研究成果及Genbank中梨S-RNase基因信息, 利用生物学比对软件Genedoee对梨S-RNase等位基因序列进行比对, 得到等位基因HV区的特异序列; 用olig06.71、PremierPremier5.0和Clustal.W等生物学软件设计特异性高、解链温度乙值接近、长度均一的oligo探针, 获得了24条32mer的oligo探针。