油桐尺蛾核型多角体病毒广西株全基因组序列

编号 zgly0000955793

文献类型 期刊论文

文献题名 油桐尺蛾核型多角体病毒广西株全基因组序列

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 罗辑  周国英  朱积余 

作者单位 中南林业科技大学林学院  广西壮族自治区林业科学研究院 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2015(5)

页码 612-617

年份 2015 

关键词 油桐尺蛾  核型多角体病毒  株系  基因组  重复序列 

文摘内容 油桐尺蛾核型多角体病毒广西株基因组序列由Sanger测序的方法得到。拼接后获得了121 268 bp序列,GC含量为36.76%。以长度不小于50 aa的序列认定为功能基因,共预测到131个开放阅读框,通过Blast比对,其中87个能注释到功能基因。对基因组序列进重复序列分析,共发现SSR位点174个,同源重复序列1个。在SSR位点中,包含6种长度的重复基序,且以富含AT的重复基序为主。同源重复序列两端为一59 bp片段或其一部分组成的重复序列,两端分别重复12次和7次,中间则为一段与重复片段无关的236 bp片段。