基于转录组分析椰心叶甲啮小蜂复壮和保种种群差异表达基因

编号 zgly0001734807

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组分析椰心叶甲啮小蜂复壮和保种种群差异表达基因

作者 刘华伟  李朝绪  李芬  吕朝军  吴少英  覃伟权 

作者单位 中国热带农业科学院椰子研究所  海南大学热带作物学院  海南大学植物保护学院 

母体文献 中国森林病虫 

年卷期 2021,40(5)

页码 21-26

年份 2021 

分类号 S763.306.4 

关键词 椰心叶甲啮小蜂  椰心叶甲  转录组  差异表达基因  退化 

文摘内容 为了明确椰心叶甲啮小蜂Tetrastichus brontispae响应种群退化的关键功能基因,通过对比其复壮和保种种群的转录组数据,对差异表达基因进行GO富集分析,并将差异基因在KEGG数据库中进行对比,获得显著性富集的通路注释信息。结果表明:相较于复壮种群,保种种群共有553个差异表达基因,其中206个基因上调表达,347个基因下调表达;这些差异基因显著富集在分子功能、细胞组分和生物过程三个大类中。分子功能中,富集到单氧酶活动的差异基因数量最多,占供试基因总数的28.57%;细胞膜富集到细胞组分中的差异基因最多,占供试基因总数的68%;而富集在生物过程中各项的差异基因都较少,仅有1~2个。差异基因主要在Hh信号通路、Hh信号通路-fly、胰腺分泌和神经活性配体受体相互作用4条通路中显著富集。椰心叶甲啮小蜂复壮和保种种群的差异基因涉及到蜂王浆主蛋白、嗅觉蛋白、细胞色素P450等,与椰心叶甲啮小蜂的个体发育、求偶交配以及产卵过程密切相关,可为进一步探究椰心叶甲啮小蜂种群退化的分子机制奠定理论基础。