新疆天山雪莲转录组注解知识库

编号 zgly0001567957

文献类型 期刊论文

文献题名 新疆天山雪莲转录组注解知识库

作者 李锦  严潘瑶  钱飞箭  邱宝义  夏雯雯  牟晓威  邱丽娟  林忠平  陈铭  祝建波  陈贤丰 

作者单位 石河子大学生命科学学院  圣庭生物信息研究所  中国农业科学院作物科学研究所  北京大学生命科学学院  浙江大学生命科学学院 

母体文献 植物学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 Q943.2 

关键词 天山雪莲  知识库  转录组  低温  抗逆  功能基因 

文摘内容 新疆天山雪莲(Sasussured involucrata)具有较高的极端低温耐受特性,为低温耐受机制研究提供了一种非常好的模式植物。新疆天山雪莲转录组注解知识库(http://www.shengtingbiology.com/Saussurea KBase/index.jsp)是基于网络数据资源的综合性数据库,由html、Perl、Perl CGI/DBD/DBI、Java和Java Script编程所设计的前端界面和用于数据存取、注释及管理的后端数据库管理系统Postgrel SQL构成。知识库包含基因组数据、转录组原始数据、质量控制数据、GC含量、功能基因序列及注释、功能基因代谢通路、功能基因的注释统计、雪莲与其它物种的转录组或基因组比较分析数据和生物分析软件包等资源。该数据库不仅有利于低温功能基因组学及低温耐受机制研究,而且为冷耐受性状物种的分子育种提供基因资源平台和理论依据。