基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的沙果小食心虫与梨小食心虫的分子鉴定

编号 zgly0001533104

文献类型 期刊论文

文献题名 基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的沙果小食心虫与梨小食心虫的分子鉴定

作者 王康  李玉婷  郑燕  段辛乐  张蒙  彭雄  陈茂华 

作者单位 西北农林科技大学植物保护学院农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室植保资源与病虫害治理教育部重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S433 

关键词 沙果小食心虫  梨小食心虫  COⅠ基因  COⅡ基因  单倍型  分子鉴定 

文摘内容 【目的】建立基于线粒体COⅠ和COⅡ基因序列的沙果小食心虫、梨小食心虫分子鉴定方法。【方法】田间采集试虫,利用PCR和基因测序技术,扩增2种食心虫的线粒体COⅠ和COⅡ基因,将获得的COⅠ和COⅡ基因序列在GenBank中进行BLAST比对,并通过GeneDoc软件分析基因序列相似性,利用Mega 5.05软件分别计算基于COⅠ和COⅡ基因序列的遗传距离,并分别构建COⅠ和COⅡ基因的系统发育树。【结果】在分析的2种食心虫样本中,沙果小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.4%以上,梨小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.6%以上,2种食心虫COⅠ基因的种间相似度为95.0%~95.6%;沙果小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.0%以上,梨小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.3%以上,2种食心虫COⅡ基因的种间相似度为94.6%~95.5%;2种食心虫COⅠ基因种间存在30个稳定变异位点,COⅡ基因种间有26个稳定变异位点。2种食心虫种内遗传距离为0.001~0.006(COⅠ)和0.001~0.010(COⅡ),种间遗传距离为0.046~0.052(COⅠ)和0.047~0.057(COⅡ),基于COⅠ和COⅡ基因的种间遗传距离均显著大于种内遗传距离。分别构建COⅠ和COⅡ基因单倍型的系统发育树,结果显示,在2个基因的系统发育树上,2种食心虫的基因序列分别位于不同的进化支,且置信度均达到100%,同种食心虫的基因序列位于相同的进化枝。【结论】可以根据本研究所用的COⅠ和COⅡ基因序列的差异性,进行沙果小食心虫和梨小食心虫的分子鉴定。