核桃属种质资源的EST-SSR标记研究

编号 zgly0000768789

文献类型 期刊论文

文献题名 核桃属种质资源的EST-SSR标记研究

学科分类 220.45;经济林学

作者 齐建勋  郝艳宾  朱艳  吴春林  王维霞  冷平 

作者单位 中国农业大学农学与生物技术学院  北京市农林科学院林业果树研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2011,38(3)

页码 441-448

年份 2011 

分类号 S664.1 

关键词 核桃  EST-SSR  亲缘关系  地理生态型 

文摘内容 用18对EST-SSR引物对核桃属(Juglans L.)中的6个黑核桃组(Sect.Rhysocayon)样品、14个核桃楸组(Sect.Cardiocaryon)样品、28个核桃组(Sect.Juglans)样品和山核桃属(Carya Nutt)中的4个长山核桃(C.illinoinensis Koch.)样品进行了PCR扩增。在18个EST-SSR位点上共获得110个等位基因,每个位点扩增等位基因3～10个,平均6.1个;各位点的观察杂合度为0.057～0.574,平均为0.323;各位点PIC值在0.3723～0.8795之间,平均为0.6890。18对EST-SSR引物在长山核桃、黑核桃组、核桃楸组、铁核桃和核桃样品中,EST-SSR位点平均有效扩增率分别为87.5%、96.3%、98.8%、100%和99.8%,说明核桃EST-SSR在种、属间具有良好的通用性。聚类分析表明: 在属间和核桃属内组间的聚类清晰,结果与传统分类一致。在核桃种内,参试样品可分为新疆、华北和西藏3个地理生态型,来自陕西的核桃样品与来自北京、山东、河南的样品混聚在一起,表明陕西核桃与华北核桃应属于同一地理生态型。在铁核桃种内,＇金沙江铁核桃1＇、＇金沙江铁核桃2＇与＇永平铁核桃1＇聚为铁核桃种。＇三台＇和＇丽江铁核桃1＇铁核桃样品,还有＇丽江核桃1＇与西藏核桃聚在一起,说明＇丽江核桃1＇应属于西藏核桃地理生态型,并且部分铁核桃与西藏核桃的亲缘关系较近。这可能是由于铁核桃与核桃混生,自然杂交使一些铁核桃后代含有了核桃基因。