林麝肺源ST1249型铜绿假单胞菌的分离鉴定及其全基因组序列分析

编号 zgly0001717379

文献类型 期刊论文

文献题名 林麝肺源ST1249型铜绿假单胞菌的分离鉴定及其全基因组序列分析

作者 伍茜  杨威  赵位  程建国  罗燕  王印  杨泽晓  姚学萍 

作者单位 四川农业大学动物医学院  四川养麝研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2020年10期

年份 2020 

分类号 S852.61 

关键词 林麝  铜绿假单胞菌  全基因组序列分析  致病性  耐药性 

文摘内容 【目的】对分离自林麝化脓肺脏的1株疑似铜绿假单胞菌(PA)进行鉴定,并分析其致病和耐药机制,为林麝PA感染化脓性疾病的防控奠定基础。【方法】将病原菌分离纯化后,依次进行生化试验、16S rRNA序列分析、药敏试验和小鼠致病性试验,并通过全基因组测序,对分离菌株进行群体进化和物种分型分析以及基因功能注释。【结果】分离自林麝化脓肺脏的1株疑似铜绿假单胞菌经鉴定与PA相符,命名为FMDP001。药敏试验显示其对阿莫西林、头孢曲松、氨曲南、多粘菌素B和林可霉素耐药;对小鼠半数致死量为9.4×10~5 CFU/mL。全基因组序列分析显示该菌基因组大小为6 955 100 bp,序列类型为ST1249,与B136-33株同源性最高,且两菌株基因组平均核苷酸一致性(ANI)值达98.93%;全基因组中共有357个序列编码FMDP001与致病性相关的基因,根据功能分为黏附、铁摄取、胞外毒性蛋白和调控系统;84个序列编码耐药基因,其中多药耐药外排泵为主要成分。【结论】从林麝化脓肺脏中分离到1株致病性较强的PA,并获得ST1249型林麝源PA的全基因组序列,序列显示该菌携带大量药物外排泵及生物膜形成相关基因,决定其具有多重耐药特性,哌拉西林等可作为该类型PA感染的临床用药。