喜树中ABA转运蛋白基因CaABAT的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001577025

文献类型 期刊论文

文献题名 喜树中ABA转运蛋白基因CaABAT的克隆及生物信息学分析

作者 王燕燕  洪雨晨  韩玉乾  于放 

作者单位 大连工业大学生物工程学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年02期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S792.99 

关键词 喜树  脱落酸  脱落酸转运蛋白  重组质粒  生物信息学 

文摘内容 以喜树叶片提取的总RNA为模板,通过RT-PCR方法扩增喜树中的ABA转运蛋白基因CaABAT全长序列,并克隆到pGMT载体中,序列分析表明,CaABAT基因4 377 bp,编码1 458个氨基酸,等电点为7.82,分子量约为164.8 KD,且该基因与拟南芥中ABA转运蛋白基因At ABCG40氨基酸序列同源性高达73%,并将该序列提交至GenBank(No.KY882555)。该蛋白的二级结构中α-螺旋为49.45%,β-折叠为11.04%,无规则卷曲39.51%,定位细胞的质膜上。且该蛋白基因功能分类体系(Gene ontology)分析显示其具有ATPase依赖的跨膜转运活性,可能参与细胞内如含氮化合物代谢过程。然后分别分段导入至酵母表达载体pDRGAL与植物表达载体pBIGD中,构建重组质粒pDRGAL-CaABAT和pBIGD-CaABAT。最终为探究CaABAT转运ABA功能以及研究其对植物次生代谢调控奠定基础。