落羽杉属种类及其杂交子代‘中山杉’系列品种的SSR指纹图谱构建及遗传关系分析

编号 zgly0001715742

文献类型 期刊论文

文献题名 落羽杉属种类及其杂交子代‘中山杉’系列品种的SSR指纹图谱构建及遗传关系分析

作者 段豪  徐建华  王紫阳  郭金博  於朝广  杨颖 

作者单位 江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心 

母体文献 植物资源与环境学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S792.99 

关键词 落羽杉属  ‘中山杉’系列品种  SSR分子标记  指纹图谱  遗传关系 

文摘内容 运用荧光标记毛细管电泳技术,对池杉[Taxodium distichum var.imbricatum（Nuttall） Croom]、墨西哥落羽杉（T.mucronatum Tenore）和落羽杉[T.distichum（Linn.） Rich.]的单株以及‘中山杉’（T.‘Zhongshanshan’）系列品种共96个样本进行SSR分子标记检测,分析供试样本的遗传多样性并分别构建指纹图谱;在此基础上,依据供试样本的Nei’s遗传距离进行聚类分析。结果显示:6对SSR引物共扩增条带91条,其中多态性条带68条;每对引物扩增条带9～31条,其中多态性条带6～27条,多态性条带百分率平均值为70.9%;各引物的多态性信息含量指数为0.476～0.793,平均值为0.658;供试样本的Nei’s基因多样性指数、Shannon’s多态性信息指数、观测杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.755、1.599、0.381和0.245。用4对SSR引物的多态性条带可构建40个‘中山杉’系列品种的指纹图谱,指纹编码数量为33,鉴别率达85.0%;用6对SSR引物的多态性条带可构建15个池杉、23个墨西哥落羽杉和18个落羽杉共56个单株的指纹图谱,指纹编码数量为49,鉴别率达91.1%,表明采用荧光标记毛细管电泳技术并运用SSR分子标记构建的指纹图谱可明显提高鉴别率。聚类分析结果显示:池杉与墨西哥落羽杉和落羽杉的Nei’s遗传距离分别为0.420和0.169,‘中山杉’系列品种与池杉、墨西哥落羽杉和落羽杉的Nei’s遗传距离分别为0.358、0.114和0.137。在Nei’s遗传距离0.405处,12个池杉单株聚为Ⅰ大类,其余84个样本聚为Ⅱ大类;Ⅱ大类可进一步分为5组,其中,‘中山杉1302’（‘Zhongshanshan 1302’）、落羽杉单株L15和‘中山杉1305’（‘Zhongshanshan 1305’）分别单独成组,‘中山杉1304’（‘Zhongshanshan 1304’）、‘中山杉112’（‘Zhongshanshan 112’）、‘中山杉149’（‘Zhongshanshan 149’）、9个落羽杉单株和1个池杉单株聚为Ⅱ4组,供试的所有墨西哥落羽杉单株与其余样本聚为Ⅱ5组。综合分析结果表明:供试的‘中山杉’系列品种与池杉的遗传关系较远,与墨西哥落羽杉的遗传关系较近;而池杉与落羽杉的遗传关系较近,与墨西哥落羽杉的遗传关系较远。