太湖地区典型菜地土壤微生物16S rDNA的PCR-RFLP分析

编号 zgly0001630933

文献类型 期刊论文

文献题名 太湖地区典型菜地土壤微生物16S rDNA的PCR-RFLP分析

作者 滕齐辉  曹慧  崔中利  王英  孙波  郝红涛  李顺鹏 

作者单位 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室  中国科学院南京土壤研究所  南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095  南京210095  南京210095中国科学院南京土壤研究所  南京210008 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2006年04期

年份 2006 

分类号 S154.3  S63 

关键词 土壤细菌多样性  间接提取法  16SrDNA克隆文库  RFLP分析 

文摘内容 土壤微生物多样性是土壤生态功能的基础,但长期以来缺乏对高强度土地利用条件下的土壤微生物多样性的认识。作者采用间接法提取了江苏省太湖地区典型菜地土壤微生物的总DNA,以细菌的通用引物27F和1492R扩增16SrDNA片段,将扩增产物与T-载体酶连,转化大肠杆菌,建立土壤微生物16SrDNA克隆文库。PCR扩增基因文库中插入的16SrDNA外源片段,用两种限制性内切酶HhaI和RsaI分别酶切,获得该土壤173个克隆的酶切指纹图谱。结果表明,HhaI和RsaI联合酶切产生了63个基因分型,文库的覆盖度达76.30%,单一酶切产生的基因分型少,但文库的覆盖度高;克隆文库中存在两种优势类群,分别占总克隆的16%和12%。16SrDNA测序结果表明,太湖地区菜地土壤细菌在分类方面主要属于-和-变形杆菌亚门。以上结果为进一步研究太湖地区菜地土壤微生物生态功能提供了基础资料。