与家蚕细胞凋亡相关的Caspase基因BmIce的克隆和序列分析

编号 zgly0001299054

文献类型 期刊论文

文献题名 与家蚕细胞凋亡相关的Caspase基因BmIce的克隆和序列分析

作者 段军  朱虹  查幸福  赵萍  夏庆友 

作者单位 西南农业大学蚕学与生物技术学院  西南农业大学蚕学与生物技术学院 农业部蚕桑学重点开放实验室  重庆400716  农业部蚕桑学重点开放实验室  重庆400716 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2005年03期

年份 2005 

分类号 S881.2 

关键词 细胞凋亡  Caspase  白细胞介素-1β转换酶  家蚕 

文摘内容 DrIce基因在果蝇的细胞调亡代谢途径中起着重要作用。采用tblastn程序将DrICE在家蚕EST数据库中进行同源性检索,检索到的EST序列进行电子延伸,根据延伸结果设计引物,用RT-PCR检测和克隆测序验证,成功地克隆到家蚕第二种Caspase基因的全长cDNA(GenBank登录号为:AY885228)。克隆的cDNA长1410bp,ORF长825bp,编码275个氨基酸残基,预测分子量为31.8kD,等电点为6.15,基因名定为BmIce。将BmIce的cD-NA与家蚕基因组序列进行比对,结果表明该基因具有6个外显子,外显子/内含子边界处均符合GT-AG规则。BmICE在氨基酸水平上与果蝇DrICE、线虫的CED-3的一致性分别为34%和29%,在第169个氨基酸残基处具有QACRG的五肽活性位点,该活性位点是Caspase家族的典型结构。与果蝇Caspase家族聚类分析中,BmICE与果蝇中具有短的N端结构域的DrICE、DCP-1及DECAY聚为一类,根据其结构分析和聚类分析,推测家蚕BmIce基因可能参与细胞凋亡的执行作用。