山核桃甲基化敏感扩增多态体系的建立与甲基化初步分析

编号 zgly0001667752

文献类型 期刊论文

文献题名 山核桃甲基化敏感扩增多态体系的建立与甲基化初步分析

作者 陈文充  贾宁  董昂  闫道良  曾燕如 

作者单位 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2019年03期

年份 2019 

分类号 S664.1 

关键词 林木育种学  山核桃  甲基化  甲基化敏感扩增多态性  表观遗传 

文摘内容 山核桃Carya cathayensis为浙江省重要的经济树种。近年来细胞生物学及分子标记的研究发现,山核桃中存在无融合生殖,天然群体的多态性不佳,存在印迹数量性状位点(iQTLs)。iQTLs与DNA甲基化有关,而DNA甲基化对生物表观遗传调控起着重要的作用,是可遗传的生物现象。甲基化敏感扩增多态(MSAP)是基于PCR扩增多态性的DNA甲基化检测方法。在建立山核桃MSAP标记体系的基础上对来自3个天然居群的山核桃单株样品进行了分析。结果表明:山核桃存在甲基化,非甲基化相对水平大于总甲基化相对水平,且两者间差异极显著(Wilcoxon Rank Sum检验P<0.001),内侧胞嘧啶甲基化相对水平远大于半甲基化相对水平,且两者间差异极显著(分子方差分析及邓肯多重比较, P<0.001);天然居群山核桃内侧胞嘧啶甲基化相对水平高,则半甲基化相对水平和非甲基化相对水平则相对较低,反之亦然;居群间存在明显的表观遗传分化,主要变异存在于居群内。此外,山核桃的MSAP体系可用于薄壳山核桃Carya illinoensis, 2个物种在位点及位点数上存在差异。图4表5参53