银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

编号 zgly0000768834

文献类型 期刊论文

文献题名 银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 李际红  邢世岩  王聪聪  张倩  付茵茵 

作者单位 山东农业大学林学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2011,38(8)

页码 1429-1436

年份 2011 

分类号 S664.3 

关键词 银杏  表观遗传学  DNA甲基化  MSAP 

文摘内容 利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于银杏基因组的甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析体系,在全基因组水平检测银杏DNA甲基化修饰水平、模式及位点等表观遗传信息。结果显示,从54对MSAP选扩引物中,选出16对MSAP引物组合,共扩增产生454条清晰可辨且可重复的DNA条带,平均每对引物扩增获得28.38条带。在全部扩增位点中,检测到甲基化位点200个,CCGG/GGCC位点甲基化修饰比例为44%。部分银杏基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了18条存在甲基化修饰的基因组DNA序列。BLASTn比对分析表明,银杏基因组中包括转录调控因子、反转录转座子、通道蛋白、启动子结合蛋白、蛋白激酶等在内的多种类型的DNA序列中均存在DNA甲基化修饰现象。