鹅掌楸EST-SSR引物开发及通用性分析

编号 zgly0000598615

文献类型 期刊论文

文献题名 鹅掌楸EST-SSR引物开发及通用性分析

作者 胥猛  李火根 

作者单位 南京林业大学林木遗传育种与基因工程重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2008,6(3)

页码 615-618

年份 2008 

分类号 S565.1  TK263.61 

关键词 EST-SSR标记  鹅掌楸  中国马褂木  通用性 

文摘内容 通过对6520条鹅掌楸EST序列进行检索,在364条ESTs中发现394个SSRs,鹅掌楸EST-SSRs平均密度为每8.5kb含有1个SSR;在检索出的SSRs中,二核苷酸重复单元的SSRs类型最多,占总数的61.9%。利用SSR-ESTs序列共设计176对EST-SSR引物,其中132对在鹅掌楸上有扩增产物,66对扩增出多态,多态性引物占所设计引物的36.9%。这批EST-SSR引物在物种之间具有较高的通用性。研究表明在鹅掌楸中表现多态的66对EST-SSR引物,85%在中国马褂木中有扩增,54%在白玉兰中有扩增。