内蒙古绒山羊皮肤KRTAPs表达谱与日照时长的相关性

编号 zgly0001548703

文献类型 期刊论文

文献题名 内蒙古绒山羊皮肤KRTAPs表达谱与日照时长的相关性

作者 赵濛  奈日乐  谢遇春  马丽娜  米璐  李金泉  刘志红 

作者单位 内蒙古农业大学动物科学学院  内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年09期

年份 2017 

分类号 S827 

关键词 绒山羊  角蛋白关联蛋白  转录水平  绒毛周期 

文摘内容 【目的】研究绒山羊皮肤部分角蛋白关联蛋白(keratin-associated protein,KRTAPs)基因的表达谱及其与全年日照变化规律间的相关性。【方法】以3只周岁阿尔巴斯型内蒙古绒山羊体侧皮肤为样本,进行高通量转录组测序(RNA-Seq),对获得的部分KRTAPs基因一年内不同月份间的转录本进行表达丰度分析,并结合当地全年日照变化规律与RT-PCR试验方法,验证KRTAP24-1、KRTAP3-1、KRTAP8-1在关键节点月份的表达谱,确定全年皮肤KRTAPs表达丰度变化与日照变化规律间的相关性。【结果】Illumina solexa高通量转录组测序表明,内蒙古绒山羊全年皮肤部分KRTAPs基因的表达具有规律性差异。RT-PCR试验验证表明,部分基因表达谱与测序表达丰度具有一致性,并且基因差异变化规律与全年日照时长的变化具有相关性。【结论】全年日照时长由长变短(夏-冬)时皮肤KRTAPs表达丰度上调,日照时长由短变长(冬-夏)时皮肤KRTAPs表达丰度下调。