PCR—DGGE技术在农田土壤微生物多样性研究中的应用

编号 zgly0000321883

文献类型 期刊论文

文献题名 PCR—DGGE技术在农田土壤微生物多样性研究中的应用

学科分类 220.1040;森林土壤学

作者 罗海峰  齐鸿雁  薛凯  张洪勋 

作者单位 中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室 

母体文献 生态学报 

年卷期 2003,23(8)

页码 1570-1575

年份 2003 

分类号 S154.3 

关键词 变性梯度凝胶电泳  DGGE  基因组DNA  16S  rRNA  微生物多样性  农田土壤 

文摘内容 变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)在微生物生态学领域有着广泛的应用。研究采用化学裂解法直接提取出不同农田土壤微生物基因组DNA, 并以此基因组DNA为模板, 选择特异性引物F357GC和R515对16S rRNA基因的V3区进行扩增, 长约230bp的PCR产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)进行分离后, 得到不同数目且分离效果较好的电泳条带。结果说明, DGGE能够对土壤样品中的不同微生物的16S rRNA基因的V3区的DNA扩增片断进行分离, 为这些DNA片断的定性和鉴定提供了条件。与传统的平板培养方法相比, 变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术能够更精确的反映出土壤微生物多样性, 它是一种有效的微生物多样性研究技术。