蔗茅野生种响应低温胁迫的数字基因表达谱

编号 zgly0001639734

文献类型 期刊论文

文献题名 蔗茅野生种响应低温胁迫的数字基因表达谱

作者 孟玉  陈疏影  徐荣  曹哲群  刘鲁峰  王先宏  何丽莲  李富生 

作者单位 云南农业大学农学与生物技术学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 Q943.2  Q945.78 

关键词 蔗茅  低温胁迫  数字基因表达谱  差异基因 

文摘内容 以蔗茅野生种(昆明蔗茅99-1)为材料,利用数字基因表达谱(DGE)技术,对4℃低温胁迫处理后的蔗茅野生种构建的c DNA文库进行差异基因表达谱分析。结果表明,低温处理24 h(ER-LT1)有2 391个基因,低温处理72 h(ER-LT2)有4 892个基因因低温处理而发生表达变化。GO功能显著性富集分析表明,差异基因主要涉及对非生物刺激反应、氧化还原过程、能量代谢以及催化活性。KEGG富集分析表明,两个不同处理时间下共同富集的通路主要为植物激素信号转导途径、植物-病原体互作通路、光合作用通路、淀粉和蔗糖代谢途径和苯丙烷生物合成途径等。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)验证2个在低温胁迫条件下的差异表达基因,其结果与DGE分析结果基本一致,证实了DGE测序结果的可靠性。