用SRAP标记研究根际土壤微生物的遗传多样性

编号 zgly0001630688

文献类型 期刊论文

文献题名 用SRAP标记研究根际土壤微生物的遗传多样性

作者 李春楠  崔海瑞  王伟博 

作者单位 浙江大学原子核农业科学研究所农业部核农学重点开放实验室  杭州市农业科学研究院园艺研究所 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2011年04期

年份 2011 

分类号 S154.3 

关键词 根际土壤微生物  SRAP  遗传多样性  遗传距离  聚类分析 

文摘内容 将近年来新建立的分子标记技术——相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)应用于土壤微生物遗传多样性研究。采用22对引物组合对20种植物根际土壤微生物进行了分析,共获得237个扩增位点,其中多态性位点221个,占93.2%。平均每对引物组合的多态位点比例(PPL)、多态信息含量(PIC)、等位基因单体型(Ah)和遗传杂合度(He)分别为93.78%、0.94、18.05和0.92,说明SRAP对根际土壤微生物具有较强的鉴别能力,也反映了本研究中20种不同植物的根际土壤微生物具有丰富的遗传多样性。水稻的2个不同种植地和4个不同发育时期间的根际土壤微生物遗传距离差异极显著,但2个不同水稻品种间的差异不显著。Shannon多样性指数揭示,水稻根际土壤微生物的遗传多样性最低,莴苣的最高。按照非加权类平均法(UPGMA)聚类,在遗传距离0.454的水平上,可将20种植物根际土壤微生物分为三类:第一类是水稻根际土壤微生物,第二类是种植于大棚温室的芹菜根际土壤微生物,第三类为其余18种旱作植物根际土壤微生物。本研究结果证明SRAP是分析土壤微生物遗传多样性的有效手段。