SSR标记在毛木耳种质资源遗传多样性研究中的应用

编号 zgly0001691302

文献类型 期刊论文

文献题名 SSR标记在毛木耳种质资源遗传多样性研究中的应用

作者 姚方杰  黄程远  孔祥会  王鹏  鲁丽鑫  方明  张友民 

作者单位 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心  吉林农业大学园艺学院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2019年12期

年份 2019 

分类号 S646.6 

关键词 聚类分析  遗传差异  子实体颜色  野生菌株  栽培菌株 

文摘内容 本研究利用基于毛木耳全基因组开发的SSR标记对27份毛木耳菌株(野生14株、栽培13株)的遗传多样性进行分析。首先随机选取3个菌株(2个野生菌株、1个栽培菌株)的DNA为模板,从144对SSR引物中筛选出扩增条带清晰、稳定性强、多态性丰富的引物24对。24对SSR引物共检测到116个多态性SSR片段,每对引物的多态性片段有3–7个,引物平均检测效率为4.83个,Shannon’s遗传多样性指数范围是0.866–1.885,多态性位点比率100%。供试菌株遗传相似系数范围是0.618–0.971,说明毛木耳种质资源具有丰富的遗传多样性。野生菌株与栽培菌株间平均遗传相似系数分别为0.746、0.779,说明毛木耳野生菌株遗传多样性更为丰富。经聚类分析,在遗传相似系数为0.680时,可将供试菌株分为无色(白色)类群Ⅰ和有色(浅黄色到红褐色)类群Ⅱ。遗传相似系数为0.704时,可将供试菌株中栽培菌株和野生菌株明显区分(14株野生菌株均在类群Ⅱ-2中,13株栽培菌株分别在类群Ⅰ和Ⅱ-1中)。本研究表明基于全基因组的SSR标记能从分子水平上揭示各菌株间的遗传差异,丰富毛木耳遗传多样性的研究手段,并为进一步进行毛木耳的品种选育、遗传学研究等提供有力手段。