用于土壤中生防芽孢杆菌B006和BH1检测的SCAR标记及其特异性

编号 zgly0001399439

文献类型 期刊论文

文献题名 用于土壤中生防芽孢杆菌B006和BH1检测的SCAR标记及其特异性

作者 耿文义  郭荣君  李世东  许修宏 

作者单位 中国农业科学院植物保护研究所/农业部生物防治重点开放实验室  东北农业大学农业资源与环境学院 

母体文献 中国生物防治学报 

年卷期 2011年02期

年份 2011 

分类号 S476.1 

关键词 SCAR分子标记  RAPD分子标记  芽孢杆菌  生物防治 

文摘内容 生防芽孢杆菌Bacillus spp.菌株B006和BH1对引发多种根腐病的真菌具有拮抗作用,研发特异性标记是研究该菌株在土壤中生态行为的关键。本研究采用16个RAPD随机引物对B006和BH1以及包括芽孢杆菌、鞘氨醇杆菌Sphingosine spp.和假单胞菌Pseudomonas spp.在内的25株参试菌株的基因组DNA多态性进行了分析,其中利用单引物B19和C01可分别扩增到仅出现于B006和BH1基因图谱中的特异性条带(大小分别为730bp和658bp)。为提高扩增的特异性和稳定性,根据B006和BH1的RAPD标记中核苷酸序列分别设计了6对和12对引物并用于菌株特异性条带的筛选,从中挑选出2对特异性最好的引物转化为SCAR引物,命名为SCAR-B006和SCAR-BH1,扩增产物大小分别为523bp和658bp。在自然土中进一步验证SCAR标记的特异性,结果表明仅在加有菌株B006或BH1的土壤样品中可扩增到相应的SCAR条带,说明了这种以PCR为基础的方法可用于土壤中菌株B006和BH1的快速鉴别。