松材线虫Bx-ubc-3基因克隆及泛素通路鉴定

编号 zgly0001672748

文献类型 期刊论文

文献题名 松材线虫Bx-ubc-3基因克隆及泛素通路鉴定

作者 许佳瑶  陈俏丽  张瑞芝  李丹蕾 

作者单位 东北林业大学林学院 

母体文献 森林工程 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S763.18 

关键词 松材线虫  泛素结合酶3  E2  泛素途径 

文摘内容 泛素途径可以调节许多关键的细胞功能。为探究松材线虫中是否存在泛素途径以及泛素途径中的关键酶基因—泛素结合酶基因ubc3,构建松材线虫c DNA文库,并进行测序、ORF分析、同源性分析、系统发育树构建、蛋白相互作用预测和分子动力学模拟等工作。克隆到长度为957bp的Bx-ubc-3基因片段。随后的序列分析表明,其开放阅读框长度为738bp,编码245个氨基酸;氨基6酸同源性分析结果表明,Bx-UBC-3与已知的泛素结合酶高度同源;蛋白互作和分子对接分析及分子动力学模拟结果表明,Bx-UBC-3的结合位点位于一个α螺旋、一个Loop1(L1)环与一个Loop2(L2)环;形成硫酯的Cys103位于L2上,构成催化裂隙; Bx-UBC-3和Bx-Rbx1之间以及Bx-UBC-3和Bx-泛素之间形成氢键。这些结果表明松材线虫中存在一条理论泛素通路,其中的关键酶Bx-UBC-3是开发高效抗线虫生物药剂的潜在靶标。