短小芽胞杆菌抑菌相关基因的高效克隆

编号 zgly0001468397

文献类型 期刊论文

文献题名 短小芽胞杆菌抑菌相关基因的高效克隆

作者 刘通  陈云鹏  李琼洁  顾振芳 

作者单位 上海交通大学农业与生物学院  农业部都市农业(南方)重点实验室 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2014年04期

年份 2014 

分类号 S476 

关键词 短小芽胞杆菌  Solexa扫描  抑菌相关基因 

文摘内容 为有效挖掘生防短小芽胞杆菌Bacillus pumilus的抑菌相关基因,对DX01菌株进行了Solexa基因组扫描,并选取其中2个代表性基因TasA和Surf2,以DX01基因组DNA为模板,采用PCR方法对其进行克隆、序列比对及系统进化分析。结果表明,DX01菌株共得到4267个基因,有3145个具有明确生物学功能的蛋白。其中,与短小芽胞杆菌抑菌活性相关的基因(簇)有84个,包括2个细菌防御酶基因、2个细菌生物膜形成相关基因、1个信号转导基因、27个细胞壁降解或水解酶基因、15个抗生素合成或转运基因、4个抑菌蛋白基因、1个次生代谢物合成基因簇及32个细菌鞭毛生物合成与调控相关基因。TasA基因在芽胞杆菌属细菌中具有高度的保守性,各同源基因的序列相似性在92%以上;而Surf2基因的同源基因在该属细菌中具有一定的变异性,有的序列相似性低至73%。