基于杨生褐盘二孢菌2个专化型的ITS2二级结构特征分析

编号 zgly0000955702

文献类型 期刊论文

文献题名 基于杨生褐盘二孢菌2个专化型的ITS2二级结构特征分析

作者 孙晓明  严东辉  贺伟  张星耀 

作者单位 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室  南京林业大学南方现代林业协同创新中心  北京林业大学 

母体文献 林业科学 

年卷期 2015(11)

页码 60-68

年份 2015 

关键词 杨生褐盘二孢菌  专化型  系统发育树  ITS2二级结构  CBC分析 

文摘内容 【目的】杨生褐盘二孢菌在杨属的不同寄主上存在2个专化型,根据形态特征和现有的一些核酸分子序列标记上不易区分;本文在利用盘二孢属核糖体转录间隔区(ITS)序列构建的系统发育树基础上,结合ITS2区分2个专化型的特异性。【方法】对23株杨生褐盘二孢菌孢子形态特征观察。以基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到ITS序列。对从NCBI数据库中下载的盘二孢属的参考ITS序列,分别利用最大似然法、最大简约法和贝叶斯法构建3种系统发育树。同时,结合应用The ITS2 database预测ITS2二级结构模型,从分子进化角度分析杨生褐盘二孢菌2个专化型的特性。