伊氏线虫真菌碳氮条件下的表型和毒力基因表达差异

编号 zgly0001727138

文献类型 期刊论文

文献题名 伊氏线虫真菌碳氮条件下的表型和毒力基因表达差异

作者 贺然  王瑞珍  应玥  曲良建  张永安 

作者单位 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业和草原局森林保护学重点实验室  北京市植物园北京市花卉园艺工程技术研究中心 

母体文献 林业科学 

年卷期 2021,57(4)

页码 107-115

年份 2021 

分类号 S718.7 

关键词 松材线虫  生防真菌  伊氏线虫真菌  转录组学 

文摘内容 【目的】研究松材线虫生防真菌伊氏线虫菌(EV)碳氮条件下表型和毒力基因表达差异,为培养高毒力菌株提供依据。【方法】分别选取碳、氮培养基培养EV,测定生长速度及产孢量。收获菌丝体并提取RNA进行建库和差异分析。结合经FDR法校正后的P值及以2为底的倍数变化的对数的绝对值(|log_(2)FoldChange|)判断差异表达的显著性。【结果】EV在氮培养条件下生长速度更快,且基因表达的总量和特异表达的数量均高于碳培养条件下表达的数量。氮组相对碳组显著差异表达的基因共有7138个,其中3571个显著上调,3567个显著下调;474个基因在氮组中特异表达,295个基因在碳组中特异表达,且氮组特异表达的基因涉及杀线虫基因的数量高于碳组。经过聚类分析,差异基因表达水平变化趋势分为4个类群,其中,在氮组表达远高于碳组表达的基因数量为165个;在碳组表达远高于氮组表达的基因数量仅有65个。枯草杆菌蛋白酶及毒素合成相关基因在氮组中显著上调表达,其中枯草杆菌蛋白酶在氮组中表达量为相对于碳组表达的2.29~363.52倍。【结论】碳、氮培养基对EV生防真菌的转录具有显著影响,氮培养条件下表达的总基因数量和特异表达的基因数量高于碳培养条件下的基因表达。具有杀灭和侵染线虫作用的枯草杆菌蛋白酶、毒素合成相关基因在氮培养下显著上调。可为高毒力EV菌株的培养、基因功能研究和菌株改良提供重要依据。